3  İlk adımlar

Şu ana kadar büyük ihtimalle grafiksel arabilimleri olan Microsoft Word ve Microsoft Excel gibi ofis programları ile çalıştınız. Bu programalar bir çok noktada işe yarasa da, ilerleyen kısımlarda göreceğimiz üzere, büyük kapasiteli verilerle çalışmaya uygun değildir.

Bu ders boyunca yeni bir çalışma sistemi ile haşır neşir olacağız. Eski bilgilerimizin ve eski alışkanlıklarımızın bazılarını unutmamız ve yenilerine yer açmamız gerekecektir.

3.1 Dik bir öğrenme eğrisi

Kullanacağımız programların dik bir öğrenme eğrisi bulunmaktadır. Yani gerçekten işe yarar bir şeyler yapabilmeniz için bir süre boyunca (3 - 4 hafta kadar) yoğun bir çalışma yapmanız ve kullanılan programların mantıklarını kavramanız gerekir.

Ancak bir kere bu çalışma sistemini kavradığınızda, sonraki adımlar daha kolay hale gelecektir. Mesela Şekil 3.1, anlattıklarımın bir özeti aslında. Biraz gözünüzü korkuttum kabul ediyorum…

Şekil 3.1: Veri analizi araçlarından R ve Python programlarının öğrenme eğrisi siyah olarak gösterilmiştir.

Ancak her işe iyi tarafından bakalım. Veri analizi, yoğun bir biçimde döküman formatı değiştirme ve tekrarlı işlemler içeren bir işlemler bütünüdür. Microsoft Excel gibi bir araçla bu analiz adımlarını ancak belli bir noktaya kadar sürdürebilirsiniz. Özellikle Bölüm 5’de belirtileceği üzere, yaşam bilimlerindeki veri miktarı artık küçük çaplı araçların altından kalkamayacağı bir seviyeye gelmiş bulunmaktadır. Bir noktadan sonra tekrarlı işler için harcayacağınız zaman gitgide artacaktır.(Şekil 3.2).

Şekil 3.2: Bu grafikte \(x\) ekseni yapılan veri analiz işleminin boyutunu, \(y\) ekseni ise o işi yapmak için gerekli zamanı göstermektedir. Kırmızı çizgi, R gibi bir programla yapılan veri analzi sürecini ifade ederken, siyah çizgi ise manuel yollarla yapılan bir işlemi göstermektedir. R ile yapılan işlemler belli bir noktaya kadar karmaşık olsa da, işin boyutu arttıkça, harcanan zaman sabit kalmaya başlamıştır.

Kafanız biraz karıştı farkediyorum. Ancak sürece güvenin. Unutmayın, hayatta önemli olan aslında süreçtir…

3.2 Genel görünüm

Eğer Bölüm 1 bölümündeki adımları tam olarak takip ettiyseniz, R ve Rstudio programlarını kurmuş olmanız gerek. Eğer programları kurmadıysanız şimdi Bölüm 1 kısmına geri dönerek, gerekli işlemleri yapınız.

Programları tam olarak kurduysanız, Şekil 3.3’da göreceğiniz bir ekran karşınıza çıkmalı. Gelin bu ekranı inceleyelim:

  • Pencere 1: Burada komut satırı karşınıza çıkmakta. R ile komut satırı üzerinden etkileşeceksiniz.
  • Pencere 2: Bu kısımda ise iki temel sekme var:
    • Environment (Çevre): Bu sekmede, R üzerinde oluşturduğumuz değişkenler bulunmaktadır.
    • History (Tarihçe): Kullandığımız komutlar burada saklanır. İstediğimiz zaman geriye dönebiliriz.
  • Pencere 3: Bu kısımda 3 farklı temel sekme bulunmaktadır:
    • Files (Dosyalar): R çalışma klasörümüzdeki dosyalar burada bulunur.
    • Plots (Grafikler): Veri analizi sırasında oluşturacağımız grafiklerin burada görüntülenecektir
    • Help (Yardım): R üzerinde paket bilgilerinin görüntülendiği yer.
Şekil 3.3: RStudio karşılama ekranı

**Yanıp sönen imleç artık komutunuzu bekliyor!

3.3 Komut satırı üzerinde çalışma

Komut satırı ekranında yanıp sönen bir imleç var. O imleç sizin komutunuzu bekliyor artık. R ile bu pencere üzerinden etkileşeceğiz. Siz bir komut yazacaksınız, R bu komutu işleyecek ve sonucu geri döndürecek.

Eğer imleç yanıp sönmüyorsa, R o sırada bir işle uğraşıyor demektir. İşin bitmesini bekleyiniz.

Komut satırı ekranını mesela bir hesap makinası olarak kullanabilirsiniz. Mesela:

34 + 45
[1] 79

R, bu işlemi yapar ve sonucu ekrana yazdırır.

İsterseniz başka işlemler de yapabilirsiniz:

12/4
[1] 3

Parantezli işlemler deneyelim:

((6+5)*(12+6))/4
[1] 49.5

Tebrikler! R üzerinde ilk komutlarınızı yazdınız!