Biyoinformatik

Ubuntu üzerine program kurulumu

İlk olarak ubuntu programımızı güncelleyelim:

sudo apt-get update
sudo apt-get upgrade

Bu komutlar uzun sürebilir. Biraz bekleyelim.

Artık istediğimiz programları kurabiliriz:

Önce fastqc programını kuralım:


sudo apt-get install fastqc

Cutadapt programı:

sudo apt-get install cutadapt

Şimdi de hizalama çalışmaları için gerekli programları kuralım:

sudo apt-get install bwa samtools